تم استخدام موليبدات الأمونيوم كمحفز في خام الفالوسيانين النحاسي، ومصدر لأيونات الموليبدات، والكواشف التحليلية، والمحفز في إزالة الماء وإزالة الكبريت في تكنولوجيا الفحم، وتصنيع المحفزات، والعناصر الغذائية الدقيقة للأسمدة، وتطبيقات الأعلاف الحيوانية، ومثبطات التآكل، ومعالجة الأسطح المعدنية، والمعادن والسبائك عالية النقاء (التلبيد)، وتصنيع الصبغات، كما يتم استخدامه في صهر الموليبدينوم فيرو وكمواد خام لإنتاج ثلاثي أكسيد الموليبدينوم ومسحوق الموليبدينوم المعدني، كما يستخدم غالبًا في صناعة النفط.