몰리브덴산 암모늄은 구리 팔로시아닌 원유의 촉매, 몰리브덴산 이온의 공급원, 분석 시약, 석탄 기술에서 탈수 및 탈황 촉매, 촉매 제조, 비료 미량 영양소, 가축 사료 응용 분야, 부식 방지제, 금속 표면 처리, 고순도 금속 및 합금(소결), 안료 제조, 또한 몰리브덴 페로 제련 및 원료로 사용됩니다. 삼산화 몰리브덴과 금속 몰리브덴 분말 생산 및 석유 산업에서도 종종 사용됩니다.